Tutorial Software Gabedit

Gabedit

Gabedit adalah antarmuka pengguna grafis untuk paket kimia komputasi seperti Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem. Hal ini dapat menampilkan berbagai hasil perhitungan termasuk dukungan untuk sebagian besar format file utama molekul. The “Molekul Builder” canggih memungkinkan untuk cepat sketsa dalam molekul dan memeriksa mereka di 3D. Grafik dapat diekspor ke berbagai format, termasuk animasi.

Fitur-fitur utama

Ø  Gabedit dapat Membuat file input untuk GAMESS (AS), GAUSSIAN, Molcas, MOLPRO, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem.

Ø  Gabedit grafis dapat menampilkan berbagai Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess, Q-Chem, (sebagian) ErgoSCF dan (sebagian) ADF hasil perhitungan, termasuk yang berikut

o   Molecular orbital.

o   Permukaan dari kerapatan elektron, potensial elektrostatik, NMR kepadatan perisai, dan properti lainnya.

o   Permukaan dapat ditampilkan dalam mode jala padat, tembus dan kawat. mereka dapat colorcoded oleh properti terpisah.

o   Kontur (colorcoded), Pesawat colorcoded, Dipole. XYZ sumbu dan sumbu utama molekul.

o   Animasi dari mode normal sesuai dengan frekuensi getaran.

o   Animasi rotasi geometri, permukaan, kontur, pesawat colorcoded, xyz dan sumbu utama molekul.

o   Animasi kontur, Animasi pesawat colorcoded.

Ø    Gabedit dapat menampilkan spektrum UV-Vis, IR dan Raman dihitung.

Ø  Gabedit dapat menghasilkan file Povray untuk geometri (termasuk ikatan hidrogen), permukaan (termasuk permukaan colorcoded), kontur, pesawat colorcoded.

Ø    Gabedit dapat menyimpan gambar di BMP, JPEG, PNG, PPM dan format PS.

Ø     Gabedit otomatis dapat menghasilkan serangkaian gambar untuk animasi (getaran, konvergensi geometri, rotasi, kontur, pesawat colorcoded).

ØSimulated Annealing dengan Dinamika Molekuler diimplementasikan dalam Gabedit (menggunakan Amber 99 parameter molekul mekanik).

Untuk menginstal aplikasi gabedit pada linux ada 2 cara yaitu :

A. Menggunakan terminal

1. ketik cd spasi/etc/apt/

2. kemudian sudo gedit sources. list akan muncul pasword: paswod ini adalah pasword linux anda (         pasword tidak akan terlihat, maka hati-hati memasukan pasword anda)

3. jika anda ingin terhubung dengan repo unnes, ganti http: ……….co.id (yg ada pada masing-masing     layar anda) dengan http://repo.unnes.ac.id/repo/(dengan cara mengganti= search kemudian replace)

4. lanjutkan dengan mengetik sudo-apt-get-update

5. ketik sudo apt insatall Gabedit

6. lalu tekan tombol enter

B. Menggunakan Synaptic

1. klik administration

2. kemudian pilih synaptic packed manager

3. pilih science( untuk aplikasi tentang science)

4. ketikkan kata “gabedit” pada kotak searc

5. klik kanan kotak yang masih berwarna putih (mark for installation)

6. klik apply